Мы собрали на этой странице последнюю информацию о различных вариантах и мутациях COVID-19, а также соответствующих моноклональных антителах (МоАт) нашего производства. Эти данные будут обновляться по мере необходимости.
=================================================================================================
Обновление (Сентябрь 2024) - Все антитела Хайтест к нуклеопротеину SARS-CoV-2, включая клоны C706, C715, C518, C524 и C527 связываются с N-концевым фрагментов нуклеопротеина N47-A173.
В июне 2022 года наша компания сравнила нуклеопротеин SARS-CoV-2 Omicron BA.4 NP с нуклепротеином дикого типа и не обнаружила различий в их распознавании антителами C706, C524, C518, C715, and C527.
BA.4 содержал следующие мутации и делеции в нуклеопротеине: P13L, del31/33, P151S, R203K, G204R, S413R (всю актуальную информацию о мутациях нуклеопротеина SARS-CoV-2 вы можете прочитать по ссылке).
Оба варианта BA.2.86 (Pirola) и EG.5 (Eris) содержат еще более короткий список мутаций в NP: P13L, del31/33, R203K, G204R, S413R.
Варианты группы FLiRT KP.3, KP.3.3, KP.2 и KP.1.1, а также аналогичные новые варианты LB.1, KS.1.1 и XEC содержат следующие мутации и делеции в нуклеопротеине: P13L, del31/33, R203K, G204R, Q229K, S413R. Из этого следует, что дополнительных мутаций в части N47-A173 не обнаружено.
Таким образом, антитела к нуклепротеинуSARS-CoV-2 нашей компании (Кат.№3CV4: клоны C706, C524, C518, C715, and C527) Хайтест способны распознавать варианты SARS-CoV-2 "Пирола", "Эрис", варианты группы FLiRT KP.3, KP.3.3, KP.2, and KP.1.1, а также аналогичные новые варианты LB.1, KS.1.1 и XEC (который является комбинацией KS.1.1 иKP.3.3).
=================================================================================================
Обновление (Январь 2023) - По нашим оценкам, все антитела к нуклеопротеину SARS-CoV-2 компании Хайтест распознают последний штамм Omicron.
Мы рекомендуем использовать в тест-системах более двух клонов антител, чтобы свести к минимуму вероятность неудачного выявления новых вариантов COVID-19.
=================================================================================================
Моноклональные антитела к нуклеопротеину (Кат. №3CV4)
Все наши МоАт к нуклеопротеину SARS-CoV-2 связываются с N-концевой частью нуклеопротеина N47-A173. Обращаем ваше внимание, что в ходе исследований циркулирующих штаммов SARS-CoV-2 было обнаружено несколько мутаций, расположенных за пределами этого участка. Однако мы стремимся изучить все актуальные мутации независимо от их расположения.
Актуальную информацию о мутациях нуклеопротеидов и их распространённости можно получить по этой ссылке.
Учёные Хайтест тестируют различные штаммы SARS-CoV-2, используя рекомбинантные антигены. Кроме того, мы внимательно изучаем отзывы клиентов, которые проверяют эффективность работы пар антител нашего производства с живыми штаммами вируса.
Ниже представлена последняя информация о различных штаммах и мутациях.
Таблица 1. Мутации и штаммы коронавируса, а также соответствующие антитела ХайТест.
Рисунок 1. Обнаружение рекомбинантного нуклеопротеина штамма Alpha (UK) в непрямом ИФА. Сигнал рекомбинантного нуклеопротеина дикого типа (кат. № 8COV3) был принят за 100%. Рекомбинантный антиген 40588-V07E7 (производство Sino Biological).
Таблица 2. Обнаружение штаммов вируса SARS-CoV-2 двумя рекомендованными парами в ИХА. Тестирование подтверждает, что обе пары обнаруживают все три штамма вируса в ИХА. Обратите внимание, что интенсивность окрашивания линии зависит от концентрации вируса, которая может отличаться в зависимости от образца. В качестве образцов использовались мазки амбулаторных пациентов. Источник данных: согласованная к публикации информация клиентов ХайТест.
Рисунок 2. Обнаружение рекомбинантного нуклеопротеина штамма Omicron парами МоАт к нуклеопротеину SARS-CoV-2 нашей компании в сэндвич-ИФА. Сигнал рекомбинантного нуклеопротеина дикого типа (кат. № 8COV3) был принят за 100%. В качестве рекомбинантного антигена штамма Omicron использовался A) антиген производства ХайТест; B) антиген производства Sino Biological.
Рисунок 3. Специфичность пар МоАт к нуклеопротеину SARS-CoV-2 в сэндвич-ИФА к различным точечным мутациям. Сигнал рекомбинантного нуклеопротеина дикого типа (кат. № 8COV3) был принят за 100%.
Рисунок 4. Специфичность пар МоАт к нуклеопротеину SARS-CoV-2 в сэндвич-ИФА к Омикрон-штамму BA.4. Сравнение рекомбинантного NP дикого типа (кат. № 8COV3) и SC-NP штамма omicron BA.4 с использованием МоАт производства нашей компании A) C706-C715, B) C706-524, C) C706-518 и D) C706-C518+C524.
Все протестированные комбинации пар 1 + 1 (подложка - детекция) наших МоАт показали способность обнаруживать все ключевые штаммы, циркулирующие в мире в настоящее время. Однако мы рекомендуем использовать более двух клонов в тестах на антиген COVID-19, так как это повысит вероятность успешного распознания тест-системой новых штаммов в будущем. Кроме этого, использование поликлональных антител к нуклеопротеину SARS-CoV-2 (Кат. № PSN5) в качестве захватывающих антител также может помочь в определении широкого спектра штаммов вируса.
Штамм Beta («южноафриканский») несет четыре мутации в своем Spike белке (K417N, E484K, N501Y, D614G). Наши МоАт распознают рекомбинантный штамм Spike-белка аналогично вирусу дикого типа.
Штамм Gamma («бразильский») содержит три мутации в своем Spike белке (K417N, E484K, N501Y). Данные мутации аналогичны обнаруженным мутациям штамма Beta. Поэтому на основании результатов тестирования взаимодействия с южноафриканским штаммом белка можно сделать вывод, что наши МоАт к Spike RBD также распознают бразильский штамм аналогично вирусу дикого типа.
Рисунок 5. Обнаружение Spike белка штамма Beta в виде рекомбинантный антигена с помощью МоАт к Spike RBD нашей компании. Сигнал рекомбинантного RBD дикого типа (кат. № 8COV1) был принят за 100%.